Ο ρόλος της Ελεγκτικής Επιτροπής είναι να ελέγχει την οικονομική κατάσταση του ΕΛΙΠΥΚΑ και να ενημερώνει σχετικά τη Γενική Συνέλευση των μελών σε ετήσια βάση, αλλά και όποτε θεωρηθεί σκόπιμο. Σε περίπτωση διαχειριστικών ανωμαλιών προκαλεί σύγκληση της Γενικής Συνέλευσης προκειμένου να θέσει υπόψη της τα πορίσματά της.